Mortzwiller vient du patronyme germanique Moritz et du latin villare : ferme
Mortzwiller est situé à la jonction des collines du Sundgau et des derniers contreforts des Vosges. Une vue étendue s'offre du haut des collines qui l'encadrent. De Mortzwiller, on découvre le massif large et imposant du Rossberg, le Bäerenkopf que traversait la frontière entre la France et l'Allemagne en 1870 et le Ballon d'Alsace aux pentes en chute raide qui descendent vers la vallée de la Doller. Vers le sud, le Jura étale sa ligne bleuâtre et, par temps clair, on peut admirer les cimes étincelantes de l'Oberland bernois.